Кафедра языков начала работу в 1950 г. С первых дней создания кафедрой заведовала Н. Г. Орлова. Подразделялась кафедра на 5 секций – английского, немецкого, французского, латинского и русского языков. Всего было 12 преподавателей и 2 лаборанта. С 1959 г. по 1991 г. кафедру возглавляла Е.П. Лещенко - сначала старший преподаватель, а с 1965 г. кандидат педагогических наук, доцент. В 1991 г. произошла реорганизация кафедры, на её базе были созданы две кафедры – кафедра иностранных языков и кафедра русского и латинского языков с основами медицинской терминологии. Кафедру иностранных языков в разные годы возглавляли Р.З. Загиддуллин, Е.Д. Ан, Л.И. Кошакбаева. В 1996 г. кафедра вновь объединилась в единую кафедру языков. С 2001 года заведующими кафедрой иностранных языков являлись: к. п. н. З. Ж. Бекмамбетова, к. п. н. Р. А. Айкенова, Р. С. Жаликенова, И.А. Лазаренко, А.А. Ахметова.

С начала 2012 учебного года зав. кафедрой иностранных языков является Бурмистрова Валерия Алексеевна, к.п.н. Она активно занимается научно-исследовательской деятельностью и на сегодняшний день имеет 85 научно-методических трудов, в том числе статьи, опубликованные в материалах конференций различного уровня, монографии, учебные пособия, методические рекомендации, спецкурсы, силлабусы. В.А. Бурмистрова  прошла стажировку в Германии и Нидерландах, ежегодно повышает свою квалификацию.

В настоящее время на кафедре работают 1 доктор наук, 4 кандидата наук, занимающих должность доцента кафедры, 3 магистра и 2 специалиста в области преподавания иностранных языков.

Кафедра располагается по ул. Ерубаева, 32. На кафедре преподаются два языка: английский и немецкий.

Основная цель учебного процесса – формирование и развитие профессионально-ориентированной иноязычной компетенции выпускников медицинского университета.

На сегодняшний день преподаватели кафедры иностранных языков работают над следующей научной темой: «Инновационные технологии в обучении иностранным языкам». Ежегодно участвуют в республиканских и международных конференциях, а также в практических семинарах. Преподаватели кафедры имеют публикации в рецензируемых журналах. Свои исследования они посвящают методике обучения иностранным языкам в неязыковом вузе, внедрению и использованию активных форм обучения, в том числе инновационных.

Со дня основания университета на кафедре иностранных языков функционирует студенческий научный кружок иностранного языка. Основная тематика научно-исследовательской работы студентов - «Новое в медицине».

Также на кафедре ведут работу 2 клуба по развитию навыков разговорной речи: английский клуб и полиязычный клуб.