Госпитальдық педиатрия кафедрасы 1967 жылы құралған. Кафедра меңгерушісі медицина ғылымының кандидаты Тен Сергей Иванович, алғашқы ассистенттері В.П.Ануфриев және О.Г.Филянская болды. 1968 жылы кафедра меңгерушісі В.П.Смоленская ассистент Г.С.Аршинова болды. 1969 жылдан 1981 жылға дейін кафедраны доцент, кейін профессор Е.И.Мерзляк меңгерді. 1969 жылы кафедра ассистенті ретінде Ф.С.Агубаев алынды. 70 жылдары кафедра К.М.Абельгазина, Ш.З.Данбаева, Л.Н.Зародина, А.В.Крикунова, Н.Е.Подгайная, Н.А.Голубева, К.А.Кенжебаева, Е.В.Пухов, Б.Б.Джанабаева, А.Б.Кулов, Н.И.Коршуноваұстаздарымен толықтырылды. Алғашқы дәрігер – лаборант А.Т.Курильченко, ал кейін доцент атанған Г.Н.Куяроваболды. Аға лаборант қызметін көп жылдары Г.М.Малаховская атқарды.
1980 жылы госпитальдық терапия кафедрасында 26 адам болды. Кафедра К.К.Дакирова,Б.Ж.Ахметжанова, А.В.Тибатина,О.Т.Садырбаева, И.А.Егорова, Ш.А.Мурзагалиев, И.Дуплякина, Т.И.Зубцова, С.В.Аляпина, И.Г.Правич, Ильдейки ұстаздарымен толықтырылды. 1980 жылы кафедра меңгерушісі қызметін доцент В.П.Ануфриев атқарды. 1982 жылы қайта ұйымдастырылып, 2 кафедра құрылды. №1 балалар аурулар кафедрасы меңгерушісі қызметін В.П.Ануфриев атқарды. №2 балалар арулар кафедрасы меңгерушісі қызметін- басында доцент И.А.Егорова басқарып, 1985 жылдан бастап доцент Л.Г.Хлопова, 1986 жылы – профессор Б.М.Коган басқарып және 1991 жылдан 1995 жылға дейін – қайта Л.Г.Хлопова меңгеруші қызметін атқарды.
Мемлекеттің қоғамдық – саяси өміріндегі және Қазақстан Республикасы тәуелсіздігін алғаннан кейінгі өзгерістерден кейін, қазақ тілінде сабақ беру өзекті мәселе болып табылады. 1995 жылы доцент А.Б.Куловтың басқаруымен педиатрия кафедрасында қазақ бөлімі ашылды. Неонатология курсын К.А.Кенжебаева басқарды. №2 балалар аурулар кафедрасының орыс бөлімін емдеу факультетінің балалар аурулар кафедрасымен біріктірді, кафедра меңгерушісі профессор Е.И.Ройтман болды.
1997 жылы қазақ және орыс бөлімін қайта біріктіріп, госпитальдық педиатрия кафедрасы құрылды, оны доцент Г.Н.Куярова, ал 1999 жылдан бастап – м.ғ.к. Бабенко басқарды. 2000 жылдан бастап кафедра қайта ұйымдастырылып, курс болып, балалар хирургия кафедрасы құрамына кірді.
2002 жылдан 2005 жылға дейін №2 балалар аурулар курсын доцент, медицина ғылымының кандидаты А.Б.Кулов меңгерді. 2005 жылдын қыркүйек айында қайта ұйымдастырылып, амбулоторлы – емханалық- педиатриямен №2 балалар аурулары кафедрасы құрылды, кафедраны доцент, медицина ғылымының кандидаты Б.Т.Тукбекова басқарды.
Қазіргі кезде №2 балалар аурулары кафедрасында профессорлар: м.ғ.д.,профессордың міндетін атқарушыС.Б.Дюсенова, м.ғ.к., профессордың міндетін атқарушыС.Т.Кизатова.
Доценттер: м.ғ.к. К.Б.Жақтаева, м.ғ.к. В.П.Ануфриев қызмет етеді.
Ассистенттер: Г.Б.Серікова, А.А.Исаева, З.Н.Мамлина, Н.А.Ерімбетова, Ж.Ж.Алимшаихина, С.М.Садвақасова, М.М.Сабиева, А.А.Жанпейсова, Р.А.Ниетбаева қызмет етеді.
Кафедраның клиникалық базасы облыстық балалар ауруханасы болып табылады, оған онкогематология және неонатология орталықтары, гастроэнтерологиялық бөлімше, эндокринді, неврологиялық, кардиоаллергологиялық, кіші жастағы патология бөлімшесі, нефрологиялық және пульманологиялық бөлімшелер кіреді. Заманауи жоғары деңгейдегі жабдықтау, емдеудің жаңа бағдарламасын қолдану 5 және 6 курс педиатриялық, жалпы тәжірибелі субординаторлармен емдеу факультетінің акушер-гинеколог студенттеріне және жоғарғы деңгейдегі бакалаврларға біліктілігін жоғарлатуға көмектеседі. Науқастарды курациялау, түңгі кезекшілік, ем- шара бөлмесінде және функциональдық диагностика бөлімшесінде жұмыс істейтін студенттер және жас, қызметтік жолдарын енді бастап келе жатқан дәрігерге керекті практикалық дағдыны меңгеруге көмектеседі.
Ұстаздар әр студентпен жекеленген жұмыс жасайды, клиникалық-теориялық конференциялар, тақырыптық және клиникалық тексерістер, компютерлі оқыту алынған білімдерін нақты түйіндейді. Кафедра, басқа педиатриялық бағыттағы кафедралардың, субординаторларды шығаратын дипломнан кейінгі студенттерді оқыту және дәрігерлер квалификациясын жоғарлату факультетінің базасы арасында алдыңғы қатарда тұр.
Кафедраның ғылыми бағыты-балалар арасындағы неонатология, кардиология, аллергология, эндокринология бағытындағы өзекті мәселелер.
