Ғылыми-зерттеу зертханасы
Басым міндеттер:
- Ғылыми және ғылыми-техникалық бағдарламалар мен жобаларды, оның ішінде ғылыми және технологиялық дамудың басым бағыттары бойынша іргелі, қолданбалы жобаларды іске асыруға жәрдемдесу, ғылыми бағыттардың тиісті саласында магистрлік, докторлық диссертациялық жұмыстарды дайындауға жәрдемдесу;
- Жаңа білім мен технологияны тарату;
- ҒЗТКЖ-ға студенттерді, магистранттарды, докторанттарды, жас ғалымдарды тарту;
- Отандық және шетелдік университеттермен және ғылыми орталықтармен бірлескен ғылыми зерттеулер жүргізу;
- Жоғары технологиялар секторына инвестициялар тарту мақсатында ғылыми және (немесе) ғылыми-техникалық қызмет нәтижелерін коммерцияландыру үшін жағдайлар жасау;
- Мемлекеттік-жекешелік әріптестік механизімдерін дамытуға жәрдемдесу;
- Ғылыми және ғылыми-техникалық сипаттағы міндеттерді шешу үшін аспаптар мен жабдықтарды тиімді пайдалану;
- Халықаралық ғылыми-техникалық қызметке қатысу.
ҒЗЗ мүмкіндіктерін бірлесіп пайдалану медицина және биология саласындағы заманауи технологияларды пайдалана отырып, өзекті заманауи проблемаларды шешуге қазақстандық зерттеушілердің күш-жігерін шоғырландыруға мүмкіндік береді деп үміттенеміз.
Бейне сәлемдесу
Лавриненко Алёна Владимировна
Зертхана меңгерушісі, PhD
+7 7212 503930, ішкі. 1203
ҒЫЛЫМИ ЖОБАЛАР
Зерттеу тобы Оңтүстік Америка мен Қазақстанның біріктірілген деректеріндегі Insilico Машиналық оқыту алгоритмінің өнімділігін бағалады, сондай-ақ үлгілерді SARS-CoV-2-ден ажырату мақсатында өздерінің ML үлгілерін үйретті. Maldi MS-тің әртүрлі ЖРИ анықтаудың инновациялық диагностикалық құралы ретіндегі әлеуеті, сондай-ақ maldi MS/ML әдісін өзгеріп жатқан эпидемиологиялық жағдайды ескере отырып, оны әдеттегі клиникалық тәжірибеге енгізер алдында қосымша оңтайландыру және растау қажеттілігі атап өтіледі.
- Kadyrova I, Yegorov S, Negmetzhanov B, Kolesnikova Y, Kolesnichenko S, Korshukov I, et al. (2022) High SARS-CoV-2 seroprevalence in Karaganda, Kazakhstan before the launch of COVID-19 vaccination. PLoS ONE 17(7): e0272008. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0272008 (Scopus -87 процентиль, Q1)
- Kadyrova, I., Kolesnichenko, S., Korshukov, I., Kolesnikova, Y., Barkhanskaya, V., Lavrinenko, A., Babenko, D. (2023). SG-APSIC1053: Detection of SARS-COV-2 in nasopharyngeal swags with MALDI-TOF MS and machine learning. Antimicrobial Stewardship & Healthcare Epidemiology, 3(S1), S2-S3. doi:10.1017/ash.2023.9
- Yegorov S., Kadyrova I., et al «Application of MALDI MS and Machine Learning to Detection of SARS-CoV-2 and non-SARS-CoV-2 Respiratory Infections» находится на рецензировании в журнале PLOS One, опубликован препринт DOI: 10.1017/ash.2023.9
Жобаның өзектілігі: жұмыс нәтижелері сепсистің иммунопатогенезін түсінуді жақсартады, бұл балалардағы ауыр жағдайларды диагностикалауға және емдеуге ықпал етуі мүмкін.
Қол жеткізілген нәтижелер: теріс гемокультуралық сепсис неонатальды сепсистің қауіп факторы болып табылады. Культуралық расталмаған клиникалық сепсисте өлім ықтималдығы 2,97 есе жоғары.
Жаңа туған нәрестелерде COVID-19-ға қарсы иммунитеттің жоғары деңгейі (68,3%) байқалады, өліммен байланысы тіркелмеген.
Некротикалық энтероколит (p 0,001), пневмония (p=0,009) және анемия (p=0,016) сепсистің теріс нәтижесімен айтарлықтай байланысты.
Неонатальды сепсистің басым себебі коагулаза-теріс стафилококктар (CNS) – 59%, Klebsiella pneumoniae _- 14% және _Enterococcus faecium - 7%. Бактерияға қарсы препараттарға (ABP) сезімталдық жоғары төзімділік деңгейімен сипатталды. Барлық S. epidermidis штамдары пенициллинге төзімді болды, 55% MRSA болып шықты
Анықталған S. epidermidis қоздырғыштары вируленттілік факторларының гендерінің жоғары деңгейіне ие болды (94,5% дейін). sspA, gehD, nuc туу салмағының төмендігімен байланысты болды, MRSA кесарь тілігімен байланысты болды, ал lip және NUC бұрын материя инфекциясы болған.
Моноциттердегі cd14 және CD4 лимфоциттеріндегі PD-1 экспрессия деңгейі жаңа туған нәрестелердегі сепсистің дамуымен байланысты.
CD8+ т жасушаларында PD-L1 экспрессиясы және CD 8+ лимфоциттер санының төмендеуі неонатальды сепсистің болжамды қолайсыз факторы болып табылады және өліммен тығыз байланысты.
Интерлейкин-6, Интерлейкин-17, альфа ісік некрозының факторы, sCD40 сепсиспен байланысты және диагностикалық маркер ретінде қызмет ете алады.
MCP-1 және sCD40 сепис өлімімен байланысты қосымша зерттеуді қажет етеді.
- Akhmaltdinova L., Zhumadilova Zh, , Kolesnichenko S. ,Lavrinenko A. , V. Avdienko O. , Panibratec G., Kadyrova I., Vinogradskaya Ye. The Presence of PDL-1 on CD8+ Lymphocytes Is Linked to Survival in Neonatal Sepsis // Children. – 2022. – Vol.9.-P.1171-1180.
- Svetlana I Kolesnichenko , Irina A Kadyrova, Alyona V Lavrinenko , Zhibek A Zhumadilova , Olga V Avdienko, Yelena V Vinogradskaya, Yevgeniy A Fominykh, Lyudmila G Panibratec, Lyudmila L Akhmaltdinova, Mortality Risk Factors of Early Neonatal Sepsis During COVID-19 Pandemic // Infection and Drug Resistance.-2022.- Vol. 15 https://doi.org/10.2147/IDR.S390723
- Колесниченко С.И., Лавриненко А.В., Кадырова И.А., Авдиенко О.В., Жумадилова Ж.А., Ахмалтдинова Л.Л. Факторы, влияющие на неблагоприятный исход сепсиса у детей. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022. Т. 24. № S1. С. 18. (ВАК)
Жобаның иммунологиялық бөлігінің өзектілігі: бұл жұмыс жаңа респираторлық инфекцияларға, соның ішінде коронавирустық инфекцияға жедел жауап беруіне, сондай-ақ осы аурулардың иммундық жүйеге әсер ету механизмін түсінуді жақсартуға мүмкіндік береді.
Жобаның иммунологиялық бөлігінің қорытындылары:
- Инфекциядан кейін 6 айға дейінгі мерзімде КВИ-ге гуморальдық иммунитеттің жоғары деңгейі тіркелді. IgA ерте кезеңдердегі ауырлық дәрежесімен және инфекцияның кеш кезеңдеріндегі бейтараптандыратын антиденелермен көбірек байланысты.
- Алғаш рет trem-1 >59.08 пг/мл-ден жоғары және NRL >2.29-дан жоғары КВИ-ден кейінгі қысқа мерзімді өлімді болжау факторлары (30 күн), ал TREM-1 ұзақ мерзімді ( 180 күн) өліммен >47.34 пг/мл-ден жоғары, сондай-ақ 277.13-тен жоғары плазмадағы PD-L1 дербес екендігі анықталды пг/мл КВИ-дан кейін бір жылдық өлім қаупінің жоғарылауын болжайды.
- Тромбоциттер асқынуларының болжаушысы болып табылатын өте ауыр пневмониядан кейін пациенттерде гепаринмен байланысты тромбоциттер факторы-4 антиденелерінің өсуі тіркелді.
- Пациенттерде латентті созылмалы инфекцияларға серопозитивтіліктің жоғары деңгейі анықталды және кеш кезеңдерде EBV антиденелерінің өсуі байқалады, бұл постковидті иммундық-делдалдық реакцияларды нашарлатуы және постковидті синдромның триері болуы мүмкін.
- Yegorov S.,Kadyrova I.,Negmetzhanov B.,Kolesnikova Ye.,Kolesnichenko S. Et al. Sputnik-V reactogenicity and immunogenicity in the blood and mucosa: a prospective cohort study Scientific Reports . – 2022. – volume 12, Article number: 13207 (2022)
- Kadyrova I., Yegorov S., Negmetzhanov B, Kolesnikova Ye, Kolesnichenko S, Korshukov I, Akhmaltdinova L, Vazenmiller D, Stupina Ye et al. High SARS-CoV-2 seroprevalence in Karaganda, Kazakhstan before the launch of COVID-19 vaccination PLoS ONE . –volume 17(7)
- Turgunova L., Mekhantseva I., Akhmaltdinova L. et al. Association of TREM‐1 and Neutrophil-to-Lymphocyte Ratio as Prognostic Markers in COVID-19 Short- and Long-Term Mortality Journal of Inflammation Research. 2023. Т. 16. С. 5807-5817.
- Yessenbayeva A, Apsalikov B, Massabayeva M, Kazymov M, Shakhanova A, Mussazhanova Z, Kadyrova I. et al. Biomarkers of immunothrombosis and polymorphisms of IL2, IL6, and IL10 genes as predictors of the severity of COVID-19 in a Kazakh population PLoS One. 2023 Jun 30;18(6):e0288139. doi: 10.1371/journal.pone.0288139. PMID: 37390087; PMCID: PMC10313014.
- Turmukhambetova A, Yegorov S, Korshukov I, Barkhanskaya V, Kolesnichenko S, Klyuyev D, Zhumadilova Z, Pralieva A, Absaghit L, Belyaev R, Babenko D, Hortelano GH, Miller MS, Vazenmiller D, Kadyrova I.. The impact of Gam-COVID-Vac, an Adv5/Adv26 COVID-19 vaccine, on the biomarkers of endothelial function, coagulation and platelet activation. PLoS One. 2023 Oct 18;18(10):e0293074. doi: 10.1371/journal.pone.0293074. PMID: 37851684; PMCID: PMC10584095
- Lavrinenko A, Kolesnichenko S, Kadyrova I, Turmukhambetova A, Akhmaltdinova L, Klyuyev D. Bacterial Co-Infections and Antimicrobial Resistance in Patients Hospitalized with Suspected or Confirmed COVID-19 Pneumonia in Kazakhstan. // Pathogens. 2023 Feb 23;12(3):370. doi: 10.3390/pathogens12030370. PMID: 36986292; PMCID: PMC10052929.
Қазіргі клиникалық тәжірибеде H. pylori _инфекциясының оңтайлы эмпирикалық терапиясы жоқ және классикалық эрадикациялық терапия режимдерінің тиімділігінің біртіндеп төмендеуі байқалады. Қазақстан _Н. pylori инфекциясының деңгейі жоғары елдерге жатады-67,5-тен 92% - ға дейін. Осы себепті HP инфекциясының алдын алу және жою мәселесі өзекті мәселе болып табылады, бірақ біздің еліміздің аумағында бұл мәселе зерттелмеген. Осы зерттеудің қорытындылары бойынша H. pylori диагностикасындағы классикалық мәдени және молекулалық-генетикалық әдістің тиімділігі немесе тиімсіздігі туралы деректер алынады. MALDIVES-TOF-та H. pylori _сәйкестендіру деректері алынады жергілікті кітапханаларды құрылады. Біз алғаш рет Қазақстандағы _H. pylori генотиптерінің өңірлік ерекшеліктерін анықтауға тырысамыз.
Қазіргі уақытта, классикалық микробиологиялық әдістермен H. pylori өсіру және идентификациялау процесі, сондай-ақ ҒЗЗ ӨЗҒИ КеАҚ ҚМУ базасында микробқа қарсы препараттарға сезімталдықты анықтау жүргізілуде.
Жоба аясында «_Helicobacter pylori _инфекцияларының ауыртпалығы және эрадикациялық терапиядағы антибиотикке төзімділік мәселесі» тақырыбында Мәскеу қаласында өткен "Покровский оқылым" III жыл сайынғы конференциясында 30-31 қазанда сәтті баяндама ұсынылды және осы конференцияның жинағында тезис жарияланды:
Бактериялық инфекциялардың ауыртпалығы және антибиотикке төзімділік мәселесі, жұқпалы аурулар бойынша III жыл сайынғы конференцияның тезистер жинағы, "Покровские оқылымдары", 30-31 қазан, 2023 жыл, Мәскеу. - Мәскеу: Медициналық Маркетинг Агенттігі, 2023. – 92 б. ISBN 978-5-6048391-1-9
